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本館在國立自然科學博物館指導下，於二樓規劃特展室，定期推出自然、科學相關主題特展；一樓為賽德克巴萊史與影(霧社事件)史料及原住民文物常設展，期能保存鄉土資產並發揚原住民文化。館內除了展覽外，也提供科學教案及織布、陶壺、鳴蟲、迷你球拍DIY(酌收工本費、預約制)，歡迎預約導覽解說。